Publications

Les publications qui suivent sont des exemples de recherches rendues possibles grâce aux données de CanPath et de ses cohortes régionales.

2020

Assessing arsenic in human toenail clippings using portable X-ray fluorescence

Auteurs : David Fleming, Samantha Crook, Colby Evans, Michel Nader, Manuel Atia, Jason Hicks, Ellen Sweeney, Christopher McFarlane, Jong Song Kim, Erin Keltie, Anil Adsesh

De simples coupures d’ongles d’orteil provenant de 60 participants du Canada atlantique ont été examinées pour déterminer le niveau d’arsenic à l’aide d’une nouvelle méthode de fluorescence à rayons X portative. La technique XRF portative utilisée dans cette étude s’est révélée prometteuse comme moyen d’évaluer la concentration d’arsenic dans les coupures d’ongle d’orteil.

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2020

Long-term exposure to a mixture of industrial SO 2, NO 2, and PM 2.5 and anti-citrullinated protein antibody positivity

Auteurs : Naizhou Zhao, Audrey Smagiassi, Marianne Hatzopoulou, Ines Colmegna, Marie Hudson, Marvin Fritzler, Philip Awadalla, Sasha Bernatsky

L’équipe de recherche a examiné les expositions au SO2, au NO2 et aux particules fines sur les anticorps protéiniques anti-citrullinés (APAC), un biomarqueur caractéristique de la polyarthrite rhumatoïde (PR). Elle a observé une corrélation positive entre les APAC et les émissions industrielles de PM2,5 et de SO2.

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2020

Reduced Cognitive Assessment Scores Among Individuals With Magnetic Resonance Imaging–Detected Vascular Brain Injury

Auteurs : Sonia S. Anand, Matthias G. Friedrich, Dipika Desai, Karleen M. Schulze, Philip Awadalla, David Busseuil, Trevor J.B. Dummer, Sébastien Jacquemont, Alexander Dick, David Kelton, Anish Kirpalani, Scott A. Lear, Jonathan Leipsic, Michael D. Noseworthy, Louise Parker, Grace Parraga, Paul Poirier, Paula Robson, Jean-Claude Tardif, Koon Teo, Jennifer Vena, Salim Yusuf, Alan R. Moody, Sandra E. Black, Eric E. Smith,

Cette étude visait à savoir si les scores d’une évaluation cognitive étaient inférieurs chez les personnes présentant un risque cardiovasculaire plus élevé et celles présentant des lésions cérébrales vasculaires latentes. Dans une population de personnes d’âge moyen vivant au sein de la communauté, les scores d’évaluation cognitive étaient plus faibles chez celles présentant des facteurs de risque cardio-vasculaires plus élevés ou des lésions cérébrales vasculaires détectées par IRM. Une grande partie du risque de faibles scores cognitifs associé à cette population peut être attribuée à un faible niveau de scolarité, des facteurs de risque cardiovasculaires plus élevés et des lésions cérébrales vasculaires détectées par IRM.

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2019

Rheumatoid arthritis-relevant DNA methylation changes identified in ACPA-positive asymptomatic individuals using methylome capture sequencing

Auteurs : Xiaojian Shao, Marie Hudson, Ines Colmegna, Celia Greenwood, Marvin Fritzler, Philip Awadalla, Tomi Pastinen, Sasha Bernatsky

Les auteurs voulaient comparer la méthylation de l’ADN chez les sujets positif / négatif pour les anticorps de la protéine anti-citrullinée, un marqueur clé de la polyarthrite rhumatoïde. Ils ont mesuré la méthylation de l’ADN chez 137 sujets, dont 63 qui étaient ACPA-positifs, 66 qui étaient négatifs et 8 sujets ayant autodéclaré une polyarthrite rhumatoïde.
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2018

Physical Activity and Cancer Incidence in Alberta’s Tomorrow Project: Results from a Prospective Cohort of 26,538 Participants.

Auteurs : AM Barberio, CM Friedenreich, BM Lynch, KL Campbell, P Arora, DR Brenner

Les auteurs ont pu déterminer qu’un niveau d’activité physique de modéré à élevé pouvait entraîner une protection modeste contre le développement de tous les cancers.

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2017

Allele-specific expression reveals interactions between genetic variation and environment

Auteurs : David Knowles, Joe Davis, Hilary Edgington, Anil Raj, Marie-Julie Fave, Xiaowei Zhu, James Potash, Myrna Weissman, Jianxin Shin, Douglas Levinson, Philip Awadalla, Sara Mostafavi, Stephen Montgomery, Alexis Battle

En combinant l’ARN-seq du sang entier à des annotations environnementales détaillées provenant de 922 personnes, les auteurs ont identifié 35 interactions GxE, contre seulement quatre au moyen de tests d’interaction GxE standard. EAGLE offre aux chercheurs de nouvelles possibilités d’identifier les interactions GxE à l’aide de données génomiques fonctionnelles.

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2017

The Comparative Reliability and Feasibility of the Past-Year Canadian Diet History Questionnaire II: Comparison of the Paper and Web

Auteurs : Geraldine Lo Siou, Ilona Cszimadi, Beatrice Boucher, Alianu Akawung, Heather Whelan, Michelle Sharma, Ala Al Rajabi, Jennifer Vena, Sharon Kirkpatrick, Anita Koushik, Isabelle Massarelli, Isabelle Rondreau, Paula Robson

Cette étude visait à évaluer la fiabilité, la faisabilité et l’acceptabilité intra et inter-versions du Questionnaire de fréquences alimentaires II du Canada auprès d’un sous-échantillon de 648 adultes. On leur a offert la version Web ou la version papier; 59 % ont préféré la version Web.

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2016

A haplotype-based normalization technique for the analysis and detection of allele specific expression

Auteurs : Alan Hodgkinson, Jean-Christophe Grenier, Elias Gbeha, Philip Awadalla

L’équipe de recherche a examiné l’expression spécifique de l’allèle (ESA), qui peut être un identifiant de la source de la maladie. Elle a été en mesure de séquencer les exomes de la cohorte CARTaGENE, trouvant un lien significatif entre la proportion de sites montrant une ESA dans le génome et le tabagisme.

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2016

Rationale, design, and methods for Canadian alliance for healthy hearts and minds cohort study (CAHHM) – a Pan Canadian cohort study

Auteurs : Sonia S. Anand, Jack V. Tu, Philip Awadalla, Sandra Black, Catherine Boileau, David Busseuil, Dipika Desai, Jean-Pierre Després, Russell J. de Souza, Trevor Dummer, Sébastien Jacquemont, Bartha Knoppers, Eric Larose, Scott A. Lear, Francois Marcotte, Alan R. Moody, Louise Parker, Paul Poirier, Paula J. Robson, Eric E. Smith, John J. Spinelli, Jean-Claude Tardif, Koon K. Teo, Natasa Tusevljak, Matthias G. Friedrich

L’Alliance canadienne cœurs et cerveaux sains (ACCCS) est une étude de cohorte pancanadienne prospective et multi-ethnique menée au Canada. Le projet a utilisé les données du PPCED. L’ACCCS est une étude de cohorte prospective axée sur la santé des adultes vivant au Canada.

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2016

Dietary assessment is a critical element of health research – Perspective from the Partnership for Advancing Nutritional and Dietary Assessment in Canada

Auteurs : Marie-Ève Labonté, Sharon I. Kirkpatrick, Rhonda C. Bell, Beatrice A. Boucher, Ilona Csizmadi, Anita Koushik, Mary R. L’Abbé, Isabelle Massarelli, Paula J. Robson, Isabelle Rondeau, Bryna Shatenstein, Amy F. Subar, and Benoît Lamarche

Article reposant sur des opinions qui fait valoir que, même si l’évaluation des apports alimentaires est une tâche difficile, elle n’est pas impossible. Les auteurs croient qu’un renforcement des capacités et des possibilités de financement devraient être facilement disponibles pour développer la recherche. Si l’on disposait de ces éléments, il y aurait une meilleure compréhension au Canada et ailleurs.

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