Publications

Les publications qui suivent sont des exemples de recherches rendues possibles grâce aux données de CanPath et de ses cohortes régionales.

2023

Added value of waist circumference to body mass index for predicting fracture risk in obesity: a prospective study from the CARTaGENE cohort

Auteurs : Anne-Frédérique Turcotte, Sonia Jean, Suzanne N Morin, Fabrice Mac-Way, Claudia Gagnon

The researchers aimed to assess associations between waist circumference (WC) and fracture incidence within BMI categories to examine whether BMI modifies the relationships. Using data from 18,236 CARTaGENE participants, they found that larger WC was associated with a greater risk for fractures among those in the normal-to-overweight category.

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2023

Multivariate extension of penalized regression on summary statistics to construct polygenic risk scores for correlated traits

Auteurs : Meriem Bahda, Jasmin Ricard, Simon L. Girard, Michel Maziade, Maripier Isabelle, Alexandre Bureau

The authors developed a summary-statistics-based multivariate penalized regression approach to improve the prediction of complex human traits and disorders, such as schizophrenia and bipolar disorder, by considering genetic correlations between these conditions. The study utilized genotypes from 29,330 subjects from the CARTaGENE cohort to determine the predictive performance of polygenic risk scores (PRS) for genetically correlated traits in simulation for several PRS construction methods.

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2023

Provincial variation in colorectal cancer screening adherence in Canada; evidence from the Canadian Partnership for Tomorrow’s Health

Auteurs : Maryam Darvishian, Amina Moustaqim-Barrette, Philip Awadalla, Parveen Bhatti, Philippe Broet, Kelly McDonald, Rachel A. Murphy, Kimberly Skead, Robin Urquhart, Jennifer Vena, Trevor J. B. Dummer

The researchers sought to assess regional variation in screening uptake, identify factors to non-adherence to screening, and estimate adherence to screening in those with differing risk profiles. Using national CanPath data, they found adherence suboptimal amongst Canadians and noticed variation by region.

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2023

Toenail arsenic species and metallome profiles associated with breast, cervical, prostate, and skin cancer prevalence in the Atlantic Partnership for Tomorrow’s Health cohort

Auteurs : Kalli Hood, Ellen Sweeney, Gabriela Ilie, Erin Keltie, Jong Sung Kim

The purpose of this study was to characterize the profiles of arsenic species and metallome in the toenails of four cancer groups, compare them to healthy participants, and assess potential associations between the profiles with cancer prevalence.

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2023

Investigating the oral microbiome in retrospective and prospective cases of prostate, colon, and breast cancer

Auteurs : Jacob T. Nearing, Vanessa DeClercq, Morgan G. I. Langille

Salivary samples from the Atlantic Partnership for Tomorrow’s Health (PATH) project and Alberta’s Tomorrow Project (ATP) to examine the existence of prostate, colon, and breast cancer biomarkers in the human oral microbiome. While no significant changes in oral microbiome diversity were detected, results indicate that there may be associations between oral microbiome and colon cancer disease status.

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2023

Mental health service use and associated predisposing, enabling and need factors in community living adults and older adults across Canada

Auteurs : Helen-Maria Vasiliadis, Jessica Spagnolo, Marie-Josée Fleury, Jean-Philippe Gouin, Pasquale Roberge, Mary Bartram, Sébastien Grenier, Grace Shen-Tu, Jennifer E. Vena, JianLi Wang

The authors utilized data from the CanPath COVID-19 health survey (May to December 2020) to conduct multivariate logistic regression analysis to determine the association between mental health service use (MHSU) and predisposing, enabling, and need factors — derived from Andersen’s model of healthcare-seeking behaviour — among five regional cohorts. Among the 45,542 adults in the study population, 6.3% of respondents reported MHSU and need factors were consistently associated with MHSU.

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2023

Mental health, cancer risk, and the mediating role of lifestyle factors in the CARTaGENE cohort study

Auteurs : Kaitlyn Gilham, Anne Gadermann, Trevor Dummer, Rachel A Murphy

Cette étude examine les liens entre la dépression, l’anxiété et le risque de cancer, ainsi que les effets médiateurs du mode de vie. À l’aide des données de 34 571 participants à CARTaGENE, les chercheurs ont trouvé des liens positifs entre les troubles de santé mentale, tous les cancers et le risque de cancer du poumon, à l’exception de l’anxiété et du cancer du poumon chez les femmes, où les liens étaient plus faibles, en tenant compte des données sociodémographiques, de la santé et du mode de vie. L’étude a également révélé que le tabagisme affectait la relation entre les troubles de santé mentale et le risque de cancer. Dans l’ensemble, l’étude suggère que les facteurs liés au mode de vie, comme le tabagisme, peuvent être importants pour comprendre la relation entre la santé mentale et le risque de cancer.

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2023

Associations between neighborhood walkability and walking following residential relocation: Findings from Alberta’s Tomorrow Project

Auteurs : Gavin R McCormack, Mohammad Javad Koohsari, Jennifer E Vena, Koichiro Oka, Tomoki Nakaya, Jonathan Chapman, Ryan Martinson, Graham Matsalla

Cette étude visait à estimer si les changements dans le potentiel piétonnier du quartier résultant de la réinstallation résidentielle étaient associés aux loisirs, au transport et aux niveau total de marche. À l’aide des données de 5977 adultes urbains (n’ayant pas déménagé, ayant déménagé vers un moindre potentiel piétonnier et ayant déménagé vers un meilleur potentiel piétonnier), les chercheurs ont constaté que le temps passé à marcher lors du suivi était plus faible chez les personnes ayant déménagé dans des quartiers moins propices à la marche, ce qui laisse penser que le fait de déménager dans des quartiers moins propices à la marche pourrait nuire à la santé.

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2023

Examining the influence of built environment on sleep disruption

Auteurs : Jaclyn Parks, Millie Baghela, Parveen Bhatti

Les chercheurs ont cherché à comprendre si la modification des aspects de l’environnement bâti améliorait le sommeil. En utilisant les données de 28 385 participants au projet BC Generations, ils ont constaté que l’augmentation de la lumière la nuit, de la pollution atmosphérique (SO2) et de la vie < 100m d’une voie principale étaient associée à un manque de sommeil. La verdure a eu un effet positif sur le sommeil.

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2023

A comparison of machine learning algorithms and traditional regression-based statistical modeling for predicting hypertension incidence in a Canadian population

Auteurs : Mohammad Ziaul Islam Chowdhury, Alexander A Leung, Robin L Walker, Khokan C Sikdar, Maeve O'Beirne, Hude Quan, Tanvir C Turin

Cette étude évalue différents algorithmes d’apprentissage automatique et compare leur rendement prédictif avec des modèles conventionnels pour prédire l’incidence de l’hypertension à l’aide des données de 18 322 participants au projet Alberta Tomorrow. L’étude a révélé peu de différence dans les performances prédictives entre les algorithmes d’apprentissage automatique et le modèle conventionnel de Cox PH. Les résultats indiquent que les modèles de régression classiques peuvent rivaliser avec les algorithmes d’apprentissage automatique en offrant une bonne précision prédictive dans un ensemble modéré de données avec un nombre raisonnable de caractéristiques.

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