Publications

Les publications qui suivent sont des exemples de recherches rendues possibles grâce aux données de CanPath et de ses cohortes régionales.

2014

High-Resolution Genomic Analysis of Human Mitochondrial RNA Sequence Variation

Auteurs : Alan Hodgkinson, Youssef Idaghdour, Elias Gbeha, Jean-Christophe Grenier, Eloide Hip-Ki, Vanessa Bruat, Jean-Philippe Goulet, Thibault de Malliard, Philip Awadalla

Les chercheurs ont séquencé l’ARN mitochondrial de 1 000 individus et ont observé une variation significative des séquences montrant des profils de modification post-transcriptionnelle. Les échantillons de CARTaGENE ont été utilisés pour découvrir cette information.

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2014

Prevalence, Awareness, and Management of CKD and Cardiovascular Risk Factors in Publicly Funded Health Care

Auteurs : Jacobien C. Verhave, Stéphan Troyanov, Frédéric Mongeau, Lorraine Fradette, Josée Bouchard, Philip Awadalla and François Madore

L’étude CARTaGENE a évalué les profils de tension artérielle, de lipides et de diabète, ainsi que divers traitements pour 20 000 personnes choisies au hasard et âgées de 40 à 69 ans. Beaucoup de patients n’étaient pas conscients de leur état de santé ou de la meilleure façon d’atteindre leurs objectifs pour parvenir à une meilleure santé. L’étude a conclu que la prise de conscience individuelle était assez faible.

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2013

Whole-Exome Sequencing Reveals a Rapid Change in the Frequency of Rare Functional Variants in a Founding Population of Humans

Auteurs : Ferran Casals ,Alan Hodgkinson ,Julie Hussin,Youssef Idaghdour,Vanessa Bruat,Thibault de Maillard,Jean-Cristophe Grenier,Elias Gbeha,Fadi F. Hamdan,Simon Girard,Jean-François Spinella,Mathieu Larivière,Virginie Saillour,Philip Awadalla

Cette étude a montré que les populations françaises renfermaient une plus grande proportion de variantes fonctionnelles potentiellement dommageables qui pourraient expliquer l’incidence des maladies génétiques dans la province. Il serait nécessaire de cataloguer en détail les variantes génétiques en rééchelonnant les populations humaines mondiales afin d’évaluer véritablement le risque de maladie.

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2013

Exploiting gene expression variation to capture gene-environment interactions for disease

Auteurs : Youseff Idaghdour, Philip Awadalla

Les deux chercheurs ont étudié l’état actuel du concept d’interactions gène-environnement transcriptionnel et discutent de son utilité pour cartographier les génotypes des maladies. L’article note que le transcriptome humain est encore relativement nouveau dans la littérature et plus d’informations à ce sujet pourrait paraître.

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2013

Cohort profile of the CARTaGENE study: Quebec’s population-based biobank for public health and personalized genomics

Auteurs : Philip Awadalla, Catherine Boileau, Yves Payette, Youssef Idaghdour, Jean-Philippe Goulet, Bartha Knoppers, Pavel Hamet, Claude Laberge

Plus de 20 000 participants ont consenti à visiter l’un des 12 sites d’évaluation où des renseignements détaillés sur la santé et la socio-démographie, des mesures physiologiques et des échantillons biologiques (sang, sérum et urine) ont été recueillis pour un total de 650 variables. Des corrélations significatives de maladies et d’affections chroniques sont observées dans ces régions, impliquant des interactions complexes, dont certaines sont décrites pour les affections chroniques majeures.

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2013

Exome sequencing identifies mutations in the gene TTC7A in French-Canadian cases with hereditary multiple intestinal atresia.

Auteurs : Mark E Samuels , Jacek Majewski, Najmeh Alirezaie, Isabel Fernandez, Ferran Casals, Natalie Patey Hélène Decaluwe, Isabelle Gosselin, Elie Haddad, Alan Hodgkinson, Youssef Idaghdour, Valerie Marchand, Jacques L Michaud Marc-André Rodrigue, Sylvie Desjardins, Stéphane Dubois, Francoise Le Deist, Philip Awadalla, Vincent Raymond,Bruno Maranda

L’atrésie intestinale multiple congénitale est un trouble mortel qui peut causer un arrêt des organes et des obstructions dans le petit et le gros intestin. Les auteurs ont examiné cinq familles différentes pour déterminer la structure génique et constaté que TTC7A est probablement un gène causal de l’atrésie intestinale multiple.

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2011

Access Arrangements’ for Biobanks: A Fine Line between Facilitating and Hindering Collaboration

Auteurs : S. Fortini, S. Pathmasiri, R. Grintuch, M. Deschenes

Cet article examine comment les accords d’accès identifient les éléments clés de ces nouveaux instruments réglementaires. Il examine également les différentes façons dont les bio-banques réglementent l’accès et les études. Enfin, il décrit les défis liés à l’élaboration d’une politique d’accès pour le projet CARTaGENE.

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2004

Strategies for consulting with the community: The cases of four large-scale genetic databases

Auteurs : B. Godard, J. Marshall, C. Laberge, B.M. Knoppers

Cet article décrit comment CARTaGENE adopte une approche axée sur les partenariats pour obtenir une plus grande participation à leurs études et mieux développer leurs bases de données.

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