Publications

Les publications qui suivent sont des exemples de recherches rendues possibles grâce aux données de CanPath et de ses cohortes régionales.

2023

Provincial variation in colorectal cancer screening adherence in Canada; evidence from the Canadian Partnership for Tomorrow’s Health

Auteurs : Maryam Darvishian, Amina Moustaqim-Barrette, Philip Awadalla, Parveen Bhatti, Philippe Broet, Kelly McDonald, Rachel A. Murphy, Kimberly Skead, Robin Urquhart, Jennifer Vena, Trevor J. B. Dummer

The researchers sought to assess regional variation in screening uptake, identify factors to non-adherence to screening, and estimate adherence to screening in those with differing risk profiles. Using national CanPath data, they found adherence suboptimal amongst Canadians and noticed variation by region.

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2023

Evaluation of the accuracy of the PLCOm2012 6-year lung cancer risk prediction model among smokers in the CARTaGENE population-based cohort

Auteurs : Rodolphe Jantzen, Nicole Ezer, Sophie Camilleri-Broët, Martin C. Tammemägi, Philippe Broët

Cette étude visait à valider un outil de prédiction du risque de cancer du poumon en utilisant les données des participants à CARTaGENE. L’outil a démontré une bonne précision dans l’identification du risque de cancer du poumon, mais a sous-estimé le nombre de cas. Cet outil pourrait nécessiter des ajustements de calibration pour la population québécoise.

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2022

Socio-Demographic Factors Associated With COVID-19 Vaccine Hesitancy Among Middle-Aged Adults During the Quebec’s Vaccination Campaign

Auteurs : Rodolphe Jantzen, Mathieu Maltais, Philippe Broët

Cette étude visait à décrire comment les caractéristiques socio-économiques et démographiques influent sur l’hésitation à se faire vacciner. À l’aide des données de 6 105 participants à l’étude CARTaGENE, les chercheurs ont constaté que les personnes nées à l’étranger et celles dont le revenu du ménage était inférieur à 100 000 $ étaient les plus réticentes.

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2022

Five-year absolute risk estimates of colorectal cancer based on CCRAT model and polygenic risk scores: A validation study using the Quebec population-based cohort CARTaGENE

Auteurs : Rodolphe Jantzen, Yves Payette, Thibault de Malliard, Catherine Labbé, Nolwenn Noisel, Philippe Broët

Cette étude visait à évaluer la performance prédictive de l’outil d’évaluation du risque de cancer colorectal parallèlement à trois scores de risque polygénique pour prédire l’apparition d’un cancer colorectal à un horizon de cinq ans. Utilisant les données de 6 747 participants à CARTaGENE, les chercheurs ont constaté que cet outil nécessiterait un meilleur calibrage avant son utilisation pratique au Québec.

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2021

Epidemiological characteristics of the COVID-19 spring outbreak in Quebec, Canada: a population-based study

Auteurs : Rodolphe Jantzen, Nolwenn Noisel, Sophie Camilleri-Broet, Catherine Labbe, Thibault de Malliard, Yves Payette, Philippe Broet

Cette étude a examiné l’impact épidémiologique et socio-économique de l’éclosion de COVID-19 au printemps 2020 sur la population du Québec. Une enquête en ligne réalisée auprès des participants de CARTaGENE a permis de rejoindre 8 129 répondants. L’étude a révélé certaines divergences entre les symptômes associés au fait de subir un test et au fait d’être déclaré positif. Les résultats soulignent également la nécessité d’accroître l’accessibilité aux tests pour la population en général.

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2021

Validation of breast cancer risk assessment tools on a French-Canadian population-based cohort

Auteurs : Rodolphe Jantzen, Yves Payette, Thibault de Malliard, Catherine Labbe, Nolwenn Noisel, Philippe Broet

Cette étude a évalué l’utilisation de l’outil d’évaluation du risque de cancer du sein (BCRAT), de l’outil d’évaluation des risques de l’étude internationale d’intervention contre le cancer du sein (IBIS), les scores de risque polygénique (PRS) et les scores combinés pour prédire l’apparition d’un cancer du sein invasif à un horizon de cinq ans au sein d’une population canadienne-française.

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2021

Agreement in the CARTaGENE cohort between self-reported medication use and claim data

Auteurs : Cristiano Moura, Yves Payette, Catherine Boileau, Michal Abrahamowicz, Louise Pilote, Sasha Bernatsky

L’équipe de recherche a étudié la concordance entre l’utilisation autodéclarée de médicaments dans les données de base de CARTaGENE et les dossiers d’assurance maladie de la province. Dans l’ensemble on a observé une concordance raisonnable entre les deux sources de données, mais des variations importantes ont été constatées pour les différentes classes de médicaments.

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2020

Diabetes, Brain Infarcts, Cognition and Small Vessels in the Canadian Alliance for Healthy Hearts and Minds Study

Auteurs : Hertzel Gerstein, Eric Smith, Chinthanie Ramasundarahettige, Dipika Desai, Philip Awadalla, Philippe Broet, Sandra Black, Trevor Dummer, Jason Hicks, Alan Moody, Jean-Claude Tardif, Koon Teo, Jennifer Vena, Salim Yusuf, Douglas Lee, Matthias Friedrich, Sonia Anand

L’étude CAHHM a examiné des imageries par résonance magnétique (IRM) cérébrales et carotidiennes et les résultats de deux tests cognitifs (DSST et MoCA) dans un échantillon transversal de 7 733 hommes et femmes. Il en ressorti que la maladie des petits vaisseaux caractérise une grande partie de la relation entre le diabète et les lésions vasculaires cérébrales. Cependant, des facteurs supplémentaires sont nécessaires pour départager la relation entre le diabète et les troubles cognitifs.

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2020

Quantifying the Predictive Accuracy of a Polygenic Risk Score for Predicting Incident Cancer Cases: Application to the CARTaGENE Cohort

Auteurs : Julianne Duhaze, Rodolpje Jantzen, Yves Payette, Thibault De Malliard, Catherine Labbe, Nolwenn Noisel, Philippe Broet

Cette étude a évalué la prévisibilité à 5 ans d’un polymorphisme nucléotide de 18 nucléotidiques SRP simples dans les cas de cancer du sein incident au sein de la cohorte CARTaGENE en utilisant des indices pseudo R^2. L’étude a conclu que l’indice pseudo-R^2 proposé est facile à utiliser et bien adapté pour évaluer le SRP en vue de prédire les événements incidents dans les études de cohorte.

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2017

Allele-specific expression reveals interactions between genetic variation and environment

Auteurs : David Knowles, Joe Davis, Hilary Edgington, Anil Raj, Marie-Julie Fave, Xiaowei Zhu, James Potash, Myrna Weissman, Jianxin Shin, Douglas Levinson, Philip Awadalla, Sara Mostafavi, Stephen Montgomery, Alexis Battle

En combinant l’ARN-seq du sang entier à des annotations environnementales détaillées provenant de 922 personnes, les auteurs ont identifié 35 interactions GxE, contre seulement quatre au moyen de tests d’interaction GxE standard. EAGLE offre aux chercheurs de nouvelles possibilités d’identifier les interactions GxE à l’aide de données génomiques fonctionnelles.

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