Publications

Les publications qui suivent sont des exemples de recherches rendues possibles grâce aux données de CanPath et de ses cohortes régionales.

2016

Design, methods and demographics from phase I of Alberta’s Tomorrow Project cohort: a prospective cohort profile

Auteurs : Paula J. Robson, Nathan M. Solbak, Tiffany R. Haig, Heather K. Whelan, Jennifer E. Vena, Alianu K. Akawung, William K. Rosner, Darren R. Brenner, Linda S. Cook, Ilona Csizmadi, Karen A. Kopciuk, . Elizabeth McGregor, Christine M. Friedenreich

Cet article décrit la phase I du projet ATP, qui examine les facteurs influant sur le cancer et d’autres maladies. Des adultes n’ayant jamais eu de cancer ont été recrutés pour l’étude. 99 % des personnes recrutées ont accepté le couplage de leurs données avec celles des bases de données administratives. Le processus de recrutement a été un franc succès.

Lire la publication
2016

A haplotype-based normalization technique for the analysis and detection of allele specific expression

Auteurs : Alan Hodgkinson, Jean-Christophe Grenier, Elias Gbeha, Philip Awadalla

L’équipe de recherche a examiné l’expression spécifique de l’allèle (ESA), qui peut être un identifiant de la source de la maladie. Elle a été en mesure de séquencer les exomes de la cohorte CARTaGENE, trouvant un lien significatif entre la proportion de sites montrant une ESA dans le génome et le tabagisme.

Lire la publication
2016

Prediabetes, depressive and anxiety symptoms, and risk of type 2 diabetes: A community-based cohort study

Auteurs : Sonya Deschenes, Rachel Burns, Eva Graham, Norbert Schimitz

Cette étude s’est penchée sur l’effet du pré-diabète et de la dépression sur le risque de diabète. Il semblait que le pré-diabète et la dépression interagissaient, avec pour conséquence une aggravation du diabète. La dépression a doublé le risque de pré-diabète, qui a progressé vers un diabète intégral. L’anxiété accroissait aussi le risque que le pré-diabète se transforme en diabète.

Lire la publication
2016

Rationale, design, and methods for Canadian alliance for healthy hearts and minds cohort study (CAHHM) – a Pan Canadian cohort study

Auteurs : Sonia S. Anand, Jack V. Tu, Philip Awadalla, Sandra Black, Catherine Boileau, David Busseuil, Dipika Desai, Jean-Pierre Després, Russell J. de Souza, Trevor Dummer, Sébastien Jacquemont, Bartha Knoppers, Eric Larose, Scott A. Lear, Francois Marcotte, Alan R. Moody, Louise Parker, Paul Poirier, Paula J. Robson, Eric E. Smith, John J. Spinelli, Jean-Claude Tardif, Koon K. Teo, Natasa Tusevljak, Matthias G. Friedrich

L’Alliance canadienne cœurs et cerveaux sains (ACCCS) est une étude de cohorte pancanadienne prospective et multi-ethnique menée au Canada. Le projet a utilisé les données du PPCED. L’ACCCS est une étude de cohorte prospective axée sur la santé des adultes vivant au Canada.

Lire la publication
2016

Dietary assessment is a critical element of health research – Perspective from the Partnership for Advancing Nutritional and Dietary Assessment in Canada

Auteurs : Marie-Ève Labonté, Sharon I. Kirkpatrick, Rhonda C. Bell, Beatrice A. Boucher, Ilona Csizmadi, Anita Koushik, Mary R. L’Abbé, Isabelle Massarelli, Paula J. Robson, Isabelle Rondeau, Bryna Shatenstein, Amy F. Subar, and Benoît Lamarche

Article reposant sur des opinions qui fait valoir que, même si l’évaluation des apports alimentaires est une tâche difficile, elle n’est pas impossible. Les auteurs croient qu’un renforcement des capacités et des possibilités de financement devraient être facilement disponibles pour développer la recherche. Si l’on disposait de ces éléments, il y aurait une meilleure compréhension au Canada et ailleurs.

Lire la publication
2016

Environments Associated with Moderate-to-Vigorous Physical Activity and Sedentary Behavior of Colorectal Cancer Survivors

Auteurs : Logan Lawrence, Michelle Stone, Daniel Rainham, Melanie Keats

Les chercheurs visaient à découvrir les endroits où les survivants du cancer colorectal s’adonnent à l’activité physique ou ont des comportements sédentaires afin d’éclairer les interventions axées sur la promotion de la santé. On a constaté que la plus grande partie de l’activité physique (73,7 %) se déroulait à la maison. On a fait valoir qu’il est important de tenir compte de l’environnement familial au moment d’examiner la façon de rendre les gens plus actifs.

Lire la publication
2016

Maelstrom Research guidelines for rigorous retrospective data harmonization

Auteurs : Isabel Fortier, Parminder Raina, Edwin R Van den Heuvel, Lauren E Griffith, Camille Craig, Matilda Saliba, Dany Doiron, Ronald P Stolk, Bartha M Knoppers, Vincent Ferretti, Peter Granda, Paul Burton

Cet article examine les meilleures façons de procéder à l’harmonisation des données. En adhérant aux lignes directrices proposées, les chercheurs ont voulu trouver la meilleure façon d’obtenir des données propres. Ils ont constaté qu’en respectant les lignes directrices, l’harmonisation des données est plus facile à réaliser.

Lire la publication
2016

Impact of the X Chromosome and sex on regulatory variation

Auteurs : Kimberly Kukurba, Princy Parsana, Brunilda Balliu, Kevin Smith, Zachary Zappala, David Knowles, Marie-Julie Fave, Joe Davis, Xin Li, Xiaowei Zhu, James Potash, Myrna Weissman, Jianxin Shi, Anshul Kundaje, Douglas Levinson, Philip Awadalla, Sara Mostafavi, Alexis Battle, and Stephen Montgomery

L’équipe de recherche a analysé les transcriptomes sanguins de 922 personnes et a été en mesure de réaliser une première analyse à grande échelle du génome des modèles de variation sexuelle/génétique. Elle a produit de la chromatine et a pu esquisser un aperçu à l’échelle du génome de la façon dont la variation génétique détermine la régulation des gènes humains et la maladie.

Lire la publication
2016

Central blood pressures in early chronic kidney disease: an analysis of CARTaGENE 

Auteurs : Rémi Goupil, Dominique Dupuis, Mohsen Agharazii, Pavel Hamet, Stéphan Troyanov, François Madore

La question de recherche examinée dans cette étude était de savoir si l’insuffisance rénale chronique (IRC) avait un lien avec l’hypertension artérielle. Les auteurs ont constaté que l’IRC précoce n’est pas associée à des paramètres hémodynamiques centraux préjudiciables.

Lire la publication
2016

Gain-of-function missense variant in SLC12A2, encoding the bumetanide-sensitive NKCC1 cotransporter, identified in human schizophrenia

Auteurs : Nancy Merner, Adriana Mercado, Arjun Khanna, Alan Hodgkinson, Vanessa Bruat, Philip Awadalla, Gerardo Gamba, Guy Rouleau, Kristopher Kahle

Cette étude a utilisé l’encodage génétique pour déterminer la relation avec la schizophrénie.

Lire la publication