Publications

Les publications qui suivent sont des exemples de recherches rendues possibles grâce aux données de CanPath et de ses cohortes régionales.

2018

Gene-by-environment interactions in urban populations modulate risk phenotypes

Auteurs : Marie-Julie Favé, Fabien C. Lamaze, David Soave, Alan Hodgkinson, Héloïse Gauvin, Vanessa Bruat, Jean-Christophe Grenier, Elias Gbeha, Kimberly Skead, Audrey Smargiassi, Markey Johnson, Youssef Idaghdour & Philip Awadalla

À partir d’une population fondatrice de quelque 1 000 individus au Québec, nous révélons un impact substantiel de l’environnement sur le transcriptome et les endophénotypes cliniques, surpassant celui de l’ascendance génétique. La pollution de l’air influe sur l’expression des gènes et les voies affectant les traits cardio-métaboliques et respiratoires, lorsqu’on neutralise l’effet de l’ascendance génétique.

Lire la publication
2018

Development of an on-line interactive map to display environmental health assessments of Canadian communities: knowledge-translation to support collaborations for health

Auteurs : Russell Jude de Souza, Rishi Arora, Lise Gauvin, Natalie Williams, A. P. Oliveira, Dipika Desai, Daniel Corsi, SV Subramanian, A. Rana, Gillian Booth, Fahad Razak, Jeff Brook, Jack Tu, Sonia S. Anand

Le rapport décrit une carte interactive en ligne élaborée par L’Alliance canadienne cœurs et cerveaux sains. Il renferme des renseignements provenant de plus de 2 000 communautés à travers le Canada!

Lire la publication
2018

Central and Brachial Blood Pressures, Statins, and Low-Density Lipoprotein Cholesterol

Auteurs : Florence Lamarche, Mohsen Agharazii, Annie-Claire Nadeau-Fredette, Francois Madore, Remi Goupii

Cette étude visait à caractériser le lien entre les statines et le LDL-c avec la pression sanguine centrale et brachiale et à quantifier leurs effets respectifs. Ils ont examiné 20 004 participants dont 16 507 pour lesquels on disposait d’une mesure de la tension artérielle centrale. En conclusion, la réduction du LDL-c était associée à une fraction seulement de la pression artérielle plus basse chez les utilisateurs de statines et semblait être principalement associée à une amélioration de la pression constante (diastolique), tandis que les voies non médiées par le LDL-c étaient principalement associées aux changements dans les composants de la pression pulsatile.

Lire la publication
2018

Associations Between Depressive Symptoms and Indices of Obesity in Adults With Prediabetes and Normal Blood Glucose Levels: Results From the Emotional Health and Wellbeing Study

Auteurs : Rachel Burns, Soyna Deschenes, Norbert Schmitz

Les symptômes dépressifs sont associés à des taux plus élevés d’incidence de diabète, mais les auteurs ne peuvent dire si les symptômes de dépression ont un lien avec le pré-diabète. Les résultats de l’étude montrent que les symptômes de dépression ont un lien positif avec l’IMC, l’indice de masse grasse et à la circonférence de la taille chez les adultes pré-diabétiques. Les liens observés chez les pré-diabétiques étaient plus forts que ceux observés chez les personnes ayant une glycémie normale.

Lire la publication
2018

Uric acid association with pulsatile and steady components of central and peripheral blood pressures

Auteurs : Fanny Lepeytre, Pierre-Luc Lavoie, Stephan Troyanov, Francois Madore, Mohsen Agharazii, Remi Goupil

L’objectif de cette étude était de déterminer si le risque cardiovasculaire qui est attribué à des niveaux élevés d’acide urique pouvait s’expliquer par des changements de la tension artérielle pulsatile centrale ou périphérique et/ou de la tension artérielle stable. Après avoir effectué une analyse multivariée portant sur plus de 20 000 personnes, les auteurs ont déterminé que les niveaux d’acide urique sérique semblent être associés à une tension artérielle centrale / périphérique stable mais non avec la TA plausible, indépendamment du sexe.

Lire la publication
2018

A Replication Study for Association of LBX1 Locus With Adolescent Idiopathic Scoliosis in French–Canadian Population

Auteurs : Dina Nada, Cedric Julien, Mark Samuels, Alain Moreau

Les auteurs voulaient voir s’il y a un lien entre les polymorphismes LBX1 et la scoliose chez les adolescents. Ils ont examiné 1 568 participants et effectué un génotypage approprié. Ils ont conclu que leurs résultats concordaient avec le lien observé entre LBX1 et AIS dans la population canadienne-française.

Lire la publication
2018

Relaxed Selection During a Recent Human Expansion

Auteurs : Stephan Peischl, Isabelle Dupanloup, Adrien Foucal, Michele Jomphe, Vanessa Bruat, Jean-Christophe Grenier, Alexandre Gouy, K.J. Gilbert, Elias Gbeha, Lars Bosshard, Eloide Hip-Ki, Mawusse Agbessi, Alan Hodgkinson, Helene Vezina, Philip Awadalla

Les auteurs ont évalué les généalogies des Canadiens-français en remontant au 17e siècle (plus de 4 000 généalogies ascendantes). En comparant la diversité exomique, l’étude a révélé que : i) les variantes nouvelles et à basse fréquence sont significativement plus délétères, et les mutations montrent des fréquences plus élevées chez les individus frontaux, ii) les mutations également délétères comportent des mutations plus fréquentes chez les individus frontaux, iii) les individus frontaux sont deux fois plus susceptibles d’être homozygotes pour de rares mutations très délétères chez les Européens.

Lire la publication
2017

Allele-specific expression reveals interactions between genetic variation and environment

Auteurs : David Knowles, Joe Davis, Hilary Edgington, Anil Raj, Marie-Julie Fave, Xiaowei Zhu, James Potash, Myrna Weissman, Jianxin Shin, Douglas Levinson, Philip Awadalla, Sara Mostafavi, Stephen Montgomery, Alexis Battle

En combinant l’ARN-seq du sang entier à des annotations environnementales détaillées provenant de 922 personnes, les auteurs ont identifié 35 interactions GxE, contre seulement quatre au moyen de tests d’interaction GxE standard. EAGLE offre aux chercheurs de nouvelles possibilités d’identifier les interactions GxE à l’aide de données génomiques fonctionnelles.

Lire la publication
2017

Industrial air emissions, and proximity to major industrial emitters, are associated with anti-citrullinated protein antibodies

Auteurs : Sasha Bernatsky, Audrey Smargiassi, Lawrence Joseph, Philip Awadalla, Ines Colmega, Marie Hudson, Marvin Fritzler

Les auteurs ont évalué les liens entre les émissions de PM25 et de SO2 et les anticorps de protéine anti-citrullinée (ACPA), un marqueur de la polyarthrite rhumatoïde (PR), et ils ont constaté un lien positif entre les ACPA et les émissions industrielles de PM2,5 / SO2. Enfin, il y avait une corrélation entre la pollution atmosphérique due aux émissions industrielles et l’ACPA, ce qui indique un rôle possible de ces expositions dans la PR.

Lire la publication
2017

The Comparative Reliability and Feasibility of the Past-Year Canadian Diet History Questionnaire II: Comparison of the Paper and Web

Auteurs : Geraldine Lo Siou, Ilona Cszimadi, Beatrice Boucher, Alianu Akawung, Heather Whelan, Michelle Sharma, Ala Al Rajabi, Jennifer Vena, Sharon Kirkpatrick, Anita Koushik, Isabelle Massarelli, Isabelle Rondreau, Paula Robson

Cette étude visait à évaluer la fiabilité, la faisabilité et l’acceptabilité intra et inter-versions du Questionnaire de fréquences alimentaires II du Canada auprès d’un sous-échantillon de 648 adultes. On leur a offert la version Web ou la version papier; 59 % ont préféré la version Web.

Lire la publication