Publications

Les publications qui suivent sont des exemples de recherches rendues possibles grâce aux données de CanPath et de ses cohortes régionales.

2018

A Replication Study for Association of LBX1 Locus With Adolescent Idiopathic Scoliosis in French–Canadian Population

Auteurs : Dina Nada, Cedric Julien, Mark Samuels, Alain Moreau

Les auteurs voulaient voir s’il y a un lien entre les polymorphismes LBX1 et la scoliose chez les adolescents. Ils ont examiné 1 568 participants et effectué un génotypage approprié. Ils ont conclu que leurs résultats concordaient avec le lien observé entre LBX1 et AIS dans la population canadienne-française.

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2018

Relaxed Selection During a Recent Human Expansion

Auteurs : Stephan Peischl, Isabelle Dupanloup, Adrien Foucal, Michele Jomphe, Vanessa Bruat, Jean-Christophe Grenier, Alexandre Gouy, K.J. Gilbert, Elias Gbeha, Lars Bosshard, Eloide Hip-Ki, Mawusse Agbessi, Alan Hodgkinson, Helene Vezina, Philip Awadalla

Les auteurs ont évalué les généalogies des Canadiens-français en remontant au 17e siècle (plus de 4 000 généalogies ascendantes). En comparant la diversité exomique, l’étude a révélé que : i) les variantes nouvelles et à basse fréquence sont significativement plus délétères, et les mutations montrent des fréquences plus élevées chez les individus frontaux, ii) les mutations également délétères comportent des mutations plus fréquentes chez les individus frontaux, iii) les individus frontaux sont deux fois plus susceptibles d’être homozygotes pour de rares mutations très délétères chez les Européens.

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2017

Polygenic risk scores distinguish patients from non‐affected adult relatives and from normal controls in schizophrenia and bipolar disorder multi‐affected kindreds

Auteurs : Sebastien Boies, Chantal Merette, Thomas Paccalet, Michel Maziade, Alexandre Bureau

Cette étude a confirmé l’utilité du SRP dans l’observation de la contribution des variantes génétiques communes au risque de schizophrénie et de trouble bipolaire dans les familles fortement touchées.

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2017

Atopic dermatitis and risk of hypertension, type 2 diabetes, myocardial infarction and stroke in a cross‐sectional analysis from the Canadian Partnership for Tomorrow Project

Auteurs : A.M. Drucker, A. Qureshi, T. Dummer, L. Parker, W. Li

Cette étude visait à déterminer s’il y a un lien entre la dermatite atopique et l’hypertension, la crise cardiaque, l’accident vasculaire cérébral et le diabète de type II. On a constaté dans une étude transversale que la dermatite atopique n’est pas vraiment un facteur de risque majeur de maladie cardiovasculaire.

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2017

Genetic variations at the human growth hormone receptor (GHR) gene locus are associated with idiopathic short stature

Auteurs : Christel Dias, Mara Giordano, Rosalie Frenchette, Simonetta Bellone, Constantin Polychronakos, Laurent Legault, Cheri Deal, Cynthia Goodyer

Les auteurs ont examiné 168 individus de petite taille de la cohorte CARTaGENE et constaté que 95 % étaient d’ascendance européenne. Ces données montrent que les variantes identifiées pourraient être des marqueurs génétiques spécifiques liés au phénotype de la petite taille.

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2017

Allele-specific expression reveals interactions between genetic variation and environment

Auteurs : David Knowles, Joe Davis, Hilary Edgington, Anil Raj, Marie-Julie Fave, Xiaowei Zhu, James Potash, Myrna Weissman, Jianxin Shin, Douglas Levinson, Philip Awadalla, Sara Mostafavi, Stephen Montgomery, Alexis Battle

En combinant l’ARN-seq du sang entier à des annotations environnementales détaillées provenant de 922 personnes, les auteurs ont identifié 35 interactions GxE, contre seulement quatre au moyen de tests d’interaction GxE standard. EAGLE offre aux chercheurs de nouvelles possibilités d’identifier les interactions GxE à l’aide de données génomiques fonctionnelles.

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2017

Industrial air emissions, and proximity to major industrial emitters, are associated with anti-citrullinated protein antibodies

Auteurs : Sasha Bernatsky, Audrey Smargiassi, Lawrence Joseph, Philip Awadalla, Ines Colmega, Marie Hudson, Marvin Fritzler

Les auteurs ont évalué les liens entre les émissions de PM25 et de SO2 et les anticorps de protéine anti-citrullinée (ACPA), un marqueur de la polyarthrite rhumatoïde (PR), et ils ont constaté un lien positif entre les ACPA et les émissions industrielles de PM2,5 / SO2. Enfin, il y avait une corrélation entre la pollution atmosphérique due aux émissions industrielles et l’ACPA, ce qui indique un rôle possible de ces expositions dans la PR.

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2017

Inherited Chromosomally Integrated Human Herpesvirus 6 and Breast Cancer

Auteurs : Annie Gravel, Isabelle Dubuc, Angela Brooks-Wilson, Kristan Aronson, Jacques Simard, Hector Velasquez-Garcia, John Spinelli, Louis Flamand

Il existe une condition affectant 1 % de la population (iciHHV-6) et les auteurs souhaitaient savoir si une telle mutation prédispose une personne au cancer. Ils ont constaté qu’il n’y avait aucun lien statistiquement significatif entre le virus iciHHV-6 et le cancer du sein chez les femmes.

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2017

Deep genealogical analysis of a large cohort of participants in the CARTaGENE project (Quebec, Canada)

Auteurs : Marc Tremblay & Gabrielle Rouleau

L’objectif principal de cette étude était de reconstruire, d’analyser et de comparer les généalogies ascendantes des participants à CARTaGENE. Les auteurs ont découvert 5 110 généalogies déjà construites provenant de quatre régions du Québec. Ils ont pu retracer des ancêtres en remontant au 17e siècle.

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2017

Community Engagement in Genetic Research: Results of the First Public Consultation for the Quebec CARTaGENE Project

Auteurs : B. Godard, J. Marshall, C. Laberge,

Cet article a montré à quel point les données de CARTaGENE seraient bénéfiques, mais avec la mise en garde que la confidentialité des participants doit être reconnue et prise en compte.

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