Publications

Les publications qui suivent sont des exemples de recherches rendues possibles grâce aux données de CanPath et de ses cohortes régionales.

2022

Personalized breast cancer onset prediction from lifestyle and health history information

Auteurs : Shi-Ang Qi, Neeraj Kumar, Jian-Yi Xu, Jaykumar Patel, Sambasivarao Damaraju, Grace Shen-Tu, Russell Greiner

Cet article propose une méthode pour prédire quand une femme développera un cancer du sein (CaS) en fonction de son état de santé et de son mode de vie à l’aide des données de 18 288 femmes du projet Alberta Tomorrow. L’approche employée a fait ressortir sept caractéristiques liées au mode de vie qu’une femme peut modifier, afin de montrer comment le modèle peut prédire les effets de tels changements. Cette méthode peut être utilisée pour identifier les interventions pour les personnes ayant une plus grande probabilité de développer un CaS.

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2022

Dietary Intake and the Neighbourhood Environment in the BC Generations Project

Auteurs : Rachel A. Murphy, Gabriela Kuczynski, Parveen Bhatti, Trevor J. B. Dummer

Cette étude a examiné comment des facteurs liés au quartier, comme l’accès aux commodités et aux relations sociales, ainsi que la verdure et le potentiel piétonnier, peuvent influer sur la consommation de fruits et de légumes. ~28 000 participants du projet BC Generations y ont participé. Les gens vivant dans des quartiers où la pauvreté matérielle et sociale était plus grande étaient moins susceptibles de respecter les recommandations sur la consommation de fruits et légumes, tandis que ceux vivant dans des quartiers plus verdoyants étaient plus susceptibles de respecter ces recommandations. Les résultats mettent en évidence comment les caractéristiques multiples d’un quartier peuvent avoir une incidence sur l’apport alimentaire.

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2022

Patterns and predictors of adherence to breast cancer screening recommendations in Alberta’s Tomorrow Project

Auteurs : Olivia K Loewen, Navjot Sandila, Grace Shen-Tu, Jennifer E Vena, Huiming Yang, Kara Patterson, Jian-Yi Xu

Cette étude a examiné les tendances de dépistage chez près de 5000 femmes dans le cadre du projet Alberta Tomorrow. La plupart des participantes étaient à jour pour le dépistage lors de leur inscription et du suivi, mais 21,6 % n’étaient pas à jour au moment du suivi, et 3,2 % n’y avaient jamais participé. Le fait d’avoir un médecin de famille était le prédicteur le plus puissant d’un dépistage régulier, tandis que les fumeuses actuelles étaient moins susceptibles de se soumettre à un dépistage régulier. L’étude souligne l’importance de promouvoir la sensibilisation aux recommandations sur le dépistage et au rôle des médecins de famille pour encourager les femmes à se soumettre au dépistage.

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2022

The role of ultra-processed food consumption and depression on type 2 diabetes incidence: a prospective community study in Quebec, Canada

Auteurs : Akankasha Sen, Anne-Sophie Brazeau, Sonya Deschênes, Hugo Ramiro Melgar-Quiñonez, Norbert Schmitz

Les chercheurs ont analysé le lien entre la dépression et la consommation d’aliments ultra-transformés (AUT) comme facteurs de risque de développer le diabète de type 2 (DT2) à l’aide de données de référence (2009-2010) de 3880 participants à CARTaGENE. Les participants ayant des symptômes dépressifs élevés et une consommation élevée d’AUT présentaient le risque le plus élevé de DT2. L’étude laisse penser que la gestion et la surveillance précoces des deux facteurs de risque pourraient être essentielles pour la prévention du diabète.

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2022

Global Biobank Meta-analysis Initiative: Powering genetic discovery across human disease

Auteurs : Wei Zhou, Masahiro Kanai, Kuan-Han H Wu, Humaira Rasheed, Kristin Tsuo, Jibril B Hirbo, Ying Wang, Arjun Bhattacharya, Huiling Zhao, Shinichi Namba, Ida Surakka, Brooke N Wolford, Valeria Lo Faro, Esteban A Lopera-Maya, Kristi Läll, Marie-Julie Favé, Juulia J Partanen, Sinéad B Chapman, Juha Karjalainen, Mitja Kurki, Mutaamba Maasha, Ben M Brumpton, Sameer Chavan, Tzu-Ting Chen, Michelle Daya, Yi Ding, Yen-Chen A Feng, Lindsay A Guare, Christopher R Gignoux, Sarah E Graham, Whitney E Hornsby, Nathan Ingold, Said I Ismail, Ruth Johnson, Triin Laisk, Kuang Lin, Jun Lv, Iona Y Millwood, Sonia Moreno-Grau, Kisung Nam, Priit Palta, Anita Pandit, Michael H Preuss, Chadi Saad, Shefali Setia-Verma, Unnur Thorsteinsdottir, Jasmina Uzunovic, Anurag Verma, Matthew Zawistowski, Xue Zhong, Nahla Afifi, Kawthar M Al-Dabhani, Asma Al Thani, Yuki Bradford, Archie Campbell, Kristy Crooks, Geertruida H de Bock, Scott M Damrauer, Nicholas J Douville, Sarah Finer, Lars G Fritsche, Eleni Fthenou, Gilberto Gonzalez-Arroyo, Christopher J Griffiths, Yu Guo, Karen A Hunt, Alexander Ioannidis, Nomdo M Jansonius, Takahiro Konuma, Ming Ta Michael Lee, Arturo Lopez-Pineda, Yuta Matsuda, Riccardo E Marioni, Babak Moatamed, Marco A Nava-Aguilar, Kensuke Numakura, Snehal Patil, Nicholas Rafaels, Anne Richmond, Agustin Rojas-Muñoz, Jonathan A Shortt, Peter Straub, Ran Tao, Brett Vanderwerff, Manvi Vernekar, Yogasudha Veturi, Kathleen C Barnes, Marike Boezen, Zhengming Chen, Chia-Yen Chen, Judy Cho, George Davey Smith, Hilary K Finucane, Lude Franke, Eric R Gamazon, Andrea Ganna, Tom R Gaunt, Tian Ge, Hailiang Huang, Jennifer Huffman, Nicholas Katsanis, Jukka T Koskela, Clara Lajonchere, Matthew H Law, Liming Li, Cecilia M Lindgren, Ruth J F Loos, Stuart MacGregor, Koichi Matsuda, Catherine M Olsen, David J Porteous, Jordan A Shavit, Harold Snieder, Tomohiro Takano, Richard C Trembath, Judith M Vonk, David C Whiteman, Stephen J Wicks, Cisca Wijmenga, John Wright, Jie Zheng, Xiang Zhou, Philip Awadalla, Michael Boehnke, Carlos D Bustamante, Nancy J Cox, Segun Fatumo, Daniel H Geschwind, Caroline Hayward, Kristian Hveem, Eimear E Kenny, Seunggeun Lee, Yen-Feng Lin, Hamdi Mbarek, Reedik Mägi, Hilary C Martin, Sarah E Medland, Yukinori Okada, Aarno V Palotie, Bogdan Pasaniuc, Daniel J Rader, Marylyn D Ritchie, Serena Sanna, Jordan W Smoller, Kari Stefansson, David A van Heel, Robin G Walters, Sebastian Zöllner; Biobank of the Americas; Biobank Japan Project; BioMe; BioVU; CanPath - Ontario Health Study; China Kadoorie Biobank Collaborative Group; Colorado Center for Personalized Medicine; deCODE Genetics; Estonian Biobank; FinnGen; Generation Scotland; Genes & Health Research Team; LifeLines; Mass General Brigham Biobank; Michigan Genomics Initiative; National Biobank of Korea; Penn Medicine BioBank; Qatar Biobank; QSkin Sun and Health Study; Taiwan Biobank; HUNT Study; UCLA ATLAS Community Health Initiative; Uganda Genome Resource; UK Biobank; Alicia R Martin, Cristen J Willer, Mark J Daly, Benjamin M Neale

L’Initiative mondiale de méta-analyse des biobanques est un réseau collaboratif de 23 biobanques, représentant plus de 2,2 millions de participants consentants dont les données génétiques sont liées aux dossiers de santé électroniques. Cet effort de collaboration améliorera le pouvoir des études d’association pangénomiques pour les maladies, profitera aux maladies peu étudiées et améliorera la prédiction des risques.

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2022

Association of dairy consumption patterns with the incidence of type 2 diabetes: Findings from Alberta’s Tomorrow Project

Auteurs : Emad Yuzbashian, Mohammadreza Pakseresht, Jennifer Vena, Catherine B Chan

Les chercheurs ont étudié la relation entre la consommation de produits laitiers et le risque de développer le diabète de type 2 (DT2) avec les données du projet Alberta Tomorrow (PAT). 15 016 femmes et 8 615 hommes ont rempli un questionnaire sur la fréquence des aliments et ont fait l’objet d’un suivi au fil du temps pour déterminer l’incidence du DT2. On a constaté qu’une consommation plus élevée de lait entier, de fromage ordinaire et de lait écrémé était associée à une diminution du risque de DT2 incident uniquement chez les hommes. L’étude indique que la combinaison de différents produits laitiers pourrait être bonne pour la santé des hommes.

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2022

Population-Based Recalibration of the Framingham Risk Score and Pooled Cohort Equations

Auteurs : Maneesh Sud, Atul Sivaswamy, Anna Chu, Peter C. Austin, Todd J. Anderson, David M.J. Naimark, Michael E. Farkouh, Douglas S. Lee, Idan Roifman, George Thanassoulis, Karen Tu, Jacob A. Udell, Harindra C. Wijeysundera, and Dennis T. Ko

Le score de risque de Framingham (FRS) et les équations de cohorte regroupées (ECR) surestiment le risque dans de nombreuses cohortes contemporaines. Cette étude visait à déterminer si le recalibrage de ces scores à l’aide de données contemporaines au niveau de la population améliore la stratification du risque des traitements aux statines.

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2022

Prediction of Cardiovascular Events by Pulse Waveform Parameters: Analysis of CARTaGENE

Auteurs : Louis-Charles Desbiens, Catherine Fortier, Annie-Claire Nadeau-Fredette, François Madore, Bernhard Hametner, Siegfried Wassertheurer, Mohsen Agharazii, Rémi Goupil

Les chercheurs ont mené la plus grande étude à ce jour visant à évaluer le lien entre des paramètres non invasifs de formes d’ondes de pouls et des événements cardiovasculaires. En ajoutant deux paramètres de formes d’ondes au score existant de maladie cardiovasculaire athérosclérotique, ils ont amélioré la prédiction cardiovasculaire et reclassé jusqu’à 5,7 % des patients dans une autre catégorie de risque.

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2022

Harnessing the power of data linkage to enrich the cancer research ecosystem in Canada

Auteurs : Robin Urquhart, Philip Awadalla, Parveen Bhatti, Trevor Dummer, Simon Gravel, Jennifer Vena, Riaz Alvi, Philippe Broet, Cynthia Kendell, Victoria Kirsh, Guillaume Lettre, Kimberly Skead, Grace Shen-Tu, Ellen Sweeney, Donna Turner

Ce résumé traite d’un projet destiné à coupler les données administratives du registre du cancer et les données administratives sur la santé à la plus grande étude sur la santé de la population au Canada, le Partenariat canadien pour la santé de demain (CanPath). Le projet vise à enrichir l’écosystème de la recherche sur le cancer au Canada en fournissant aux chercheurs un ensemble de données complet qui comprend des données sur la génétique, l’environnement, le mode de vie et le comportement. Les données couplées seront rendues disponibles au moyen d’une solution infonuagique appelée CanPath Data Safe Haven, qui est accessible aux chercheurs grâce à un protocole sécurisé. Le projet répondra aux préoccupations liées à l’accessibilité des données sur le cancer au Canada, apportera plus de valeur aux données existantes et favorisera une meilleure compréhension des répercussions du cancer sur les populations marginalisées.

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2022

Cohort Profile: The Ontario Health Study (OHS)

Auteurs : Victoria A Kirsh, Kimberly Skead, Kelly McDonald, Nancy Kreiger, Julian Little, Karen Menard, John McLaughlin, Sutapa Mukherjee, Lyle J Palmer, Vivek Goel, Mark P Purdue, Philip Awadalla

Le profil de cohorte de l’ÉSO décrit l’histoire et la valeur de sa plateforme de recherche pour la communauté scientifique au sens large. L’ÉSO suit 225 000 personnes tout au long de leur vie, activement et passivement, mettant à la disposition des chercheurs sur le cancer et les maladies chroniques des données électroniques anonymisées sur la génomique, l’environnement, le mode de vie et la santé.

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