Exploiting gene expression variation to capture gene-environment interactions for disease
Les deux chercheurs ont étudié l’état actuel du concept d’interactions gène-environnement transcriptionnel et discutent de son utilité pour cartographier les génotypes des maladies. L’article note que le transcriptome humain est encore relativement nouveau dans la littérature et plus d’informations à ce sujet pourrait paraître.
Cohort profile of the CARTaGENE study: Quebec’s population-based biobank for public health and personalized genomics
Plus de 20 000 participants ont consenti à visiter l’un des 12 sites d’évaluation où des renseignements détaillés sur la santé et la socio-démographie, des mesures physiologiques et des échantillons biologiques (sang, sérum et urine) ont été recueillis pour un total de 650 variables. Des corrélations significatives de maladies et d’affections chroniques sont observées dans ces régions, impliquant des interactions complexes, dont certaines sont décrites pour les affections chroniques majeures.
Exome sequencing identifies mutations in the gene TTC7A in French-Canadian cases with hereditary multiple intestinal atresia.
L’atrésie intestinale multiple congénitale est un trouble mortel qui peut causer un arrêt des organes et des obstructions dans le petit et le gros intestin. Les auteurs ont examiné cinq familles différentes pour déterminer la structure génique et constaté que TTC7A est probablement un gène causal de l’atrésie intestinale multiple.
Access Arrangements’ for Biobanks: A Fine Line between Facilitating and Hindering Collaboration
Cet article examine comment les accords d’accès identifient les éléments clés de ces nouveaux instruments réglementaires. Il examine également les différentes façons dont les bio-banques réglementent l’accès et les études. Enfin, il décrit les défis liés à l’élaboration d’une politique d’accès pour le projet CARTaGENE.
The Canadian Partnership for Tomorrow Project: building a pan-Canadian research platform for disease prevention
Cet article décrit les défis qu’une étude de cohorte pancanadienne doit relever pour examiner le cancer et les maladies chroniques. L’espoir que laisse entrevoir cette cohorte est qu’elle pourrait servir de plateforme de recherche majeure pour l’étude des causes de la maladie aux niveaux national et international. Les auteurs décrivent comment ils ont recruté les participants, quelles provinces sont impliquées, et comment cette cohorte particulière est unique.
Quality, quantity and harmony: the DataSHaPER approach to integrating data across bioclinical studies
Le DataSHaPER est utilisé en lien avec le PPCED pour intégrer les données de manière qu’elles puissent être facilement harmonisées et mises en commun.
Pharmacogenomic data sample collection and storage: ethical issues and policy approaches
Cet article a fait ressortir que les données de CARTaGENE deviendraient plus importantes au fil du temps dans la recherche en pharmaco-génomique pour découvrir le lien entre les variations génétiques et les effets liés aux médicaments. La capacité des créateurs de bases de données de répondre aux questions éthiques déterminera comment la pharmocogénomique pourra être intégrée à la pratique clinique traditionnelle.
Strategies for consulting with the community: The cases of four large-scale genetic databases
Cet article décrit comment CARTaGENE adopte une approche axée sur les partenariats pour obtenir une plus grande participation à leurs études et mieux développer leurs bases de données.