Publications

Les publications qui suivent sont des exemples de recherches rendues possibles grâce aux données de CanPath et de ses cohortes régionales.

2015

Replication study of MATR3 in familial and sporadic amyotrophic lateral sclerosis

Auteurs : Claire Leblond, Ziv Gan-Or, Dan Spiegelman, Sandra Laurent, Anna Szuto, Alan Hodgkinson, Alexandre Dionne-Laporte, Pierre Provencher, Mamde de Carvalho, Sandro Orru, Denis Brunet, Jean-Pierre Bouchard, Philip Awadalla, Nicholas Dupre, Patrick Dion, Guy Rouleau

Dans cette étude, les auteurs ont examiné les mutations de MATR3 (gène associé à la SLA). Ils ont évalué la fréquence dans les populations canadiennes-françaises par rapport à un groupe témoin. Ils ont été en mesure de déterminer quelles protéines sont associées à la SLA.

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2015

Comparison of the Effect of Thiazide Diuretics and Other Antihypertensive Drugs on Central Blood Pressure: Cross‐Sectional Analysis Among Nondiabetic Patients

Auteurs : Cristiano S. Moura, Stella S. Daskalopoulou, Linda E. Levesque, Sasha Bernatsky, Michal Abrahamowicz, Meytal A. Tsadok, Shadi Rajabi, Louise Pilote

Cette étude a utilisé les données de CARTaGENE pour déterminer la non-infériorité des diurétiques thiazidiques (DT) par rapport à différentes classes de médicaments antihypertenseurs au niveau de la pression artérielle centrale. Aucune différence majeure n’a été relevée et il a été démontré que les DT sont au moins aussi efficaces que les autres médicaments de première ligne disponibles.

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2015

Inherited chromosomally integrated human herpesvirus 6 as a predisposing risk factor for the development of angina pectoris

Auteurs : Annie Gravel, Isabelle Dubuc, Guillaum Morissette, Ruth Sedlak, Keith Jerome, Louis Flamand

Les résultats de cette étude portant sur 20 000 personnes ont montré que la prévalence de l’angine de poitrine était trois fois plus élevée chez les personnes porteuses du virus iciHHV-6 + que chez celles qui n’avaient pas de copie du virus. L’étude a également montré que le virus iciHHV-6 peut contribuer au développement de l’angine.

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2015

Recombination affects accumulation of damaging and disease-associated mutations in human populations

Auteurs : Julie G Hussin, Alan Hodgkinson, Youssef Idaghdour, Jean-Christophe Grenier, Jean-Philippe Goulet, Elias Gbeha, Elodie Hip-Ki & Philip Awadalla

À l’aide de données de séquençage à grande couverture provenant de plus de 1 400 individus des projets 1000 Génomes et CARTaGENE, les auteurs montrent que le taux de recombinaison module la distribution de variantes délétères putatives sur l’ensemble du génome humain.

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2015

Association of age-dependent height and bone mineral density decline with increased arterial stiffness and rate of fractures in hypertensive individuals

Auteurs : Rana EL-Bikai, Muhammad Tahir, Johanne Tremblay, Michel Joffres, Ondřej Šeda, Lucie Šedová, Philip Awadalla, Claude Laberge, Bartha-Maria Knoppers, Pierre Dumas, Daniel Gaudet, Louis-Georges Ste-Marie, Pavel Hamet

Les auteurs voulaient établir s’il y a un lien entre la taille, la rigidité artérielle et les fractures osseuses. À la fin de l’étude, ils ont pu déterminer que les personnes de plus courte stature étaient plus susceptibles de souffrir de rigidité artérielle et d’hypertension.

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2014

Genetically encoded impairment of neuronal KCC2 cotransporter function in human idiopathic generalized epilepsy

Auteurs : Kristopher Kahle, Nancy Merner, Perrine Friedel, Liliya Silayeva, Bo Liang, Arjun Khanna, Yuze Shang, Pamela LaChance-Touchette, Cynthia Bourassa, Annie Levert, Patrick Dion, Brian Walcott, Dan Spiegelman, Alexandre Dionne-Laporte, Alan Hodgkinson, Philip Awadalla, Hamid Nikbakht, Jacek Majewski, Patrick Cossette, Tarek Deeb, Stephen Moss, Igor Medina, Guy Rouleau

Ces données décrivent une nouvelle variante de KCC2 significativement associée à une maladie humaine et indiquent que l’affaiblissement génétiquement codé de la régulation fonctionnelle de KCC2 pourrait être un facteur de risque pour le développement de l’IGE humain.

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2014

High-Resolution Genomic Analysis of Human Mitochondrial RNA Sequence Variation

Auteurs : Alan Hodgkinson, Youssef Idaghdour, Elias Gbeha, Jean-Christophe Grenier, Eloide Hip-Ki, Vanessa Bruat, Jean-Philippe Goulet, Thibault de Malliard, Philip Awadalla

Les chercheurs ont séquencé l’ARN mitochondrial de 1 000 individus et ont observé une variation significative des séquences montrant des profils de modification post-transcriptionnelle. Les échantillons de CARTaGENE ont été utilisés pour découvrir cette information.

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2014

Prevalence, Awareness, and Management of CKD and Cardiovascular Risk Factors in Publicly Funded Health Care

Auteurs : Jacobien C. Verhave, Stéphan Troyanov, Frédéric Mongeau, Lorraine Fradette, Josée Bouchard, Philip Awadalla and François Madore

L’étude CARTaGENE a évalué les profils de tension artérielle, de lipides et de diabète, ainsi que divers traitements pour 20 000 personnes choisies au hasard et âgées de 40 à 69 ans. Beaucoup de patients n’étaient pas conscients de leur état de santé ou de la meilleure façon d’atteindre leurs objectifs pour parvenir à une meilleure santé. L’étude a conclu que la prise de conscience individuelle était assez faible.

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2013

Whole-Exome Sequencing Reveals a Rapid Change in the Frequency of Rare Functional Variants in a Founding Population of Humans

Auteurs : Ferran Casals ,Alan Hodgkinson ,Julie Hussin,Youssef Idaghdour,Vanessa Bruat,Thibault de Maillard,Jean-Cristophe Grenier,Elias Gbeha,Fadi F. Hamdan,Simon Girard,Jean-François Spinella,Mathieu Larivière,Virginie Saillour,Philip Awadalla

Cette étude a montré que les populations françaises renfermaient une plus grande proportion de variantes fonctionnelles potentiellement dommageables qui pourraient expliquer l’incidence des maladies génétiques dans la province. Il serait nécessaire de cataloguer en détail les variantes génétiques en rééchelonnant les populations humaines mondiales afin d’évaluer véritablement le risque de maladie.

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2013

Exploiting gene expression variation to capture gene-environment interactions for disease

Auteurs : Youseff Idaghdour, Philip Awadalla

Les deux chercheurs ont étudié l’état actuel du concept d’interactions gène-environnement transcriptionnel et discutent de son utilité pour cartographier les génotypes des maladies. L’article note que le transcriptome humain est encore relativement nouveau dans la littérature et plus d’informations à ce sujet pourrait paraître.

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