Identification of a Breast Cancer Susceptibility Locus at 4q31.22 Using a Genome-Wide Association Study Paradigm
La conception de l’étude comprenait également les 11 variantes de GWAS précédemment rapportées par divers consortiums entre les années 2007-2009 pour (i) permettre des comparaisons de la taille des effets, et (ii) identifier les variantes pronostiques putatives à travers les études. Toutes les associations rapportées de SNP avec le cancer du sein ont également été rajustées en fonction de l’indice de masse corporelle (IMC). Nous observons une forte association avec 4q31.22-rs1429142 (ratio d’incidence probable par allèle combiné et intervalle de confiance de 95 % = 1,28 [1,17-1,41] et P combiné = 1,5 × 10 (-7)), après rajustement en fonction de l’IMC.
Assessing SNP-SNP Interactions among DNA Repair, Modification and Metabolism Related Pathway Genes in Breast Cancer Susceptibility
Les résultats de l’étude fournissent un cadre pour évaluer les SNP, montrant des effets de localisation unique statistiquement faibles mais reproductibles pour les effets épistatiques contribuant à la susceptibilité à la maladie.
ETHNOPRED: a novel machine learning method for accurate continental and sub-continental ancestry identification and population stratification correction
Cette étude a examiné les moyens de contourner les limites de l’ascendance autodéclarée, des marqueurs d’information sur l’ascendance, du contrôle génomique, de l’association structurée et de l’analyse des composantes principales. Les auteurs ont trouvé qu’ETHNOPRED offrait une bonne alternative.
Breast cancer prediction using genome wide single nucleotide polymorphism data
Les chercheurs ont étudié 696 participantes en utilisant un modèle de SNC pour déterminer si un nouveau sujet développerait ou non un cancer du sein.
Prevalence of meeting physical activity guidelines for cancer prevention in Alberta
Les auteurs ont examiné les lignes directrices sur l’activité physique pour 14 294 personnes âgées de 35 à 64 ans et constaté que 23 à 55 % des participants les respectaient, selon la ligne directrice mesurée (CSEP, ACS, USDHHS, WCRF/AICR). Les femmes étaient moins susceptibles de se conformer à certaines lignes directrices que les hommes. L’étude a conclu que les gens de l’Alberta, principalement les femmes, n’étaient pas assez actifs pour en tirer des avantages sur le plan de la prévention du cancer.
A two-stage association study identifies methyl-CpG-binding domain protein 2 gene polymorphisms as candidates for breast cancer susceptibility
Cette étude s’est penchée sur un modèle d’association en deux étapes utilisant de marqueurs provenant d’une étude à l’échelle du génome. Les auteurs ont limité leur analyse aux polymorphismes de l’ADN et ont sélectionné 22 SNPS. Certains SNP se sont avérés pertinents pour la susceptibilité au cancer du sein parmi les populations.
Hours spent and energy expended in physical activity domains: Results from The Tomorrow Projectcohort in Alberta, Canada
Un sondage intitulé Past Year Total Physical Activity Questionnaire a été adressé à 15 591 participants et traitait du niveau d’activité physique de chaque personne. Les personnes considérées comme inactives réalisaient la plus grande partie de leur activité au travail. L’une des hypothèses était que les changements au niveau de l’environnement et des politiques pourraient être adaptés afin de favoriser une plus grande dépense d’énergie et une réduction du temps passé en position assise.
Potential novel candidate polymorphisms identified in genome-wide association study for breast cancer susceptibility
Les auteurs ont réalisé une étude d’association en deux étapes auprès d’une cohorte de 3064 femmes. L’étude comportait deux étapes distinctes. L’étape I a porté sur un examen des polymorphismes mononucléotidiques, tandis que l’étape II a reproduit des marqueurs spécifiques issus de l’étape I. Après avoir complété les deux étapes, les auteurs ont pu identifier diverses régions génétiques, et les SNP étudiés pourraient servir de site potentiel pour le cancer du sein dans une autre étude de réplication.
Exploring Statistical Approaches to Diminish Subjectivity of Cluster Analysis to Derive Dietary Patterns: The Tomorrow Project
Les chercheures souhaitaient explorer les habitudes alimentaires et ont élaboré un questionnaire sur la fréquence alimentaire adressé à 6 445 hommes et 10 299 femmes. L’analyse a porté sur les protéines, les graisses et les calories, et l’information a été compilée à l’aide d’une méthode de mise en grappe.
The Canadian Partnership for Tomorrow Project: building a pan-Canadian research platform for disease prevention
Cet article décrit les défis qu’une étude de cohorte pancanadienne doit relever pour examiner le cancer et les maladies chroniques. L’espoir que laisse entrevoir cette cohorte est qu’elle pourrait servir de plateforme de recherche majeure pour l’étude des causes de la maladie aux niveaux national et international. Les auteurs décrivent comment ils ont recruté les participants, quelles provinces sont impliquées, et comment cette cohorte particulière est unique.